民國87年12月18日奉教育部核定成立物理治療系,民國88年8月辦理聯合招生,招收進修部四技學生一班, 提供職校畢業生之進修機會(88學年度),89學年度,進修部四技學生再增一班,90學年度起招收日間部四技學生一班,92學年度 ,日間部四技學生增一班,進修部四技學生減一班,95學年度,進修部四技停招。至98學年度物理治療系各年級日間部兩班。
本系承襲校、院教育理念,並經全體師生十餘年努力耕耘,已發展為具有特色之技職物理治療人才培育園地。除了國考必備的四大專科外,本系之教育特色為「培養學生發展次專科」,包含運動傷害防護與運動指導 、長照復能以及科技輔具製作等專業能力,整合師資、課程模組、設備與實作場域等資源,使本系畢業生具有市場競爭力、專業的證照能力及未來職場發展潛力。
本系目前擁有專任教師11位,教授2位、副教授4位、助理教授5位,均具有至少5年以上豐富臨床實務經驗,且大多服務於醫學中心等級醫院,專長涵蓋骨科、神經、心肺與小兒物理治療四大專科。