民國87年12月18日奉教育部核定成立物理治療系，民國88年8月辦理聯合招生，招收進修部四技學生一班， 提供職校畢業生之進修機會(88學年度)，89學年度，進修部四技學生再增一班，90學年度起招收日間部四技學生一班，92學年度 ，日間部四技學生增一班，進修部四技學生減一班，95學年度，進修部四技停招。至98學年度物理治療系各年級日間部兩班。

本系承襲校、院教育理念，並經全體師生十餘年努力耕耘，已發展為具有特色之技職物理治療人才培育園地。除了國考必備的四大專科外，本系之教育特色為「培養學生發展次專科」，包含運動傷害防護與運動指導 、長照復能以及科技輔具製作等專業能力，整合師資、課程模組、設備與實作場域等資源，使本系畢業生具有市場競爭力、專業的證照能力及未來職場發展潛力。

本系目前擁有專任教師11位，教授2位、副教授4位、助理教授5位，均具有至少5年以上豐富臨床實務經驗，且大多服務於醫學中心等級醫院，專長涵蓋骨科、神經、心肺與小兒物理治療四大專科。